Большая часть вирусов, в том числе тех, что вызывают разные патологии, остаются неизученными и поэтому фактически нераспознаваемыми
фото с веб-сайта pixabay.com
Во время быстрого развития пандемии коронавируса COVID-19 журнальчик Viruses опубликовал обзор, посвященный дилемме обнаружения новейших патогенных микробов, включая вирусы неведомой этиологии — такие, как несчастный коронавирус.
«По различным статистическим оценкам, на нашей планетке насчитывается наиболее 320 тыщ разных вирусов, ведущих паразитическую деятельность на млекопитающих, — гласит один из создателей обзора, сотрудник лаборатории исторической генетики, радиоуглеродного анализа и прикладной физики Камиль Хафизов. — Но из такового огромного контраста человеку пока удалось более-менее изучить меньше 1-го процента этих таинственных организмов».
Большая часть вирусов, в том числе тех, что вызывают у человека респираторные, пищеварительные и остальные патологии, остаются неизученными и поэтому фактически нераспознаваемыми.
Дело в том, что используемые на данный момент в ежедневной мед практике тест-системы способны выявлять лишь определенные, довольно отлично изученные штаммы вируса.
«Практически люди пробуют рассмотреть большущее море угроз через игольное ушко», — пишут создатели в собственной работе.
В ней анализируются, а именно, недочеты способа полимеразной цепной реакции (ПЦР-смерти)). Этот главный для современной медицины метод молекулярного тестирования микробов фактически не дозволяет найти практически неизученные вирусы, что составляет одну из основных заморочек современной вирусологии.
Но, к Счастью, уже возникают способы, потенциально способные решить делему выявления и идентификации новейших микробов, и им в размещенном обзоре уделено основное пространство.
Самой многообещающей из таковых технологий создатели работы именуют NGS (от англ. — Next Generation Sequencing), либо cеквенирование новейшего поколения. По-русски его нередко именуют также высокопроизводительным секвенированием, так как он дозволяет читать весьма огромное количество участков ДНК (Дезоксирибонуклеиновая кислота — макромолекула, обеспечивающая хранение, передачу из поколения в поколение и реализацию генетической программы развития и функционирования живых организмов) сразу.
«Неотъемлемая часть способа — действенные математические методы, — разъясняет соавтор обзора, аспирантка МФТИ Алина Мацвай. — Они разрешают в процессе чтения генома неведомого вируса либо другого мельчайшего организма “пробивать” его по всем имеющимся не малым геномным библиотекам, предсказывая различные характеристики новейшего вируса и в том числе его патогенный потенциал».
Главный недочет NGS — высочайшая стоимость оборудования и реагентов для проведения исследовательских работ сиим способом, также достаточно долгие процессы подготовки проб, секвенирования и анализа данных. Эти ограничения, вместе с твердыми требованиями к квалификации лабораторного персонала, мешают внедрению способа в массовую мед практику. Но с каждым годом стоимость технологии неприклонно понижается, а скорость, точность и производительность вырастают.
По утверждению Камиля Хафизова, эпидемия коронавируса наглядно показала значимость способов NGS в выявлении новейших патогенов в клинических образчиках, также для исследования молекулярных устройств передачи вируса от звериных к человеку.
Может быть, разработка будет сертифицирована для внедрения в здравоохранении уже в наиблежайшие годы.
вместе с учеными Столичного физико-технического института, в авторский коллектив базовой работы вошли представители Центра стратегического планирования Министерства здравоохранения Рф, столичного Сеченовского института и института Пастера в Санкт-Петербурге.